膏方在长期的医疗实践中显示丁其独特的功效，之所以能够在临床的应用过程中产生令人满意的疗效是有其理论基础的。膏方治疗学的理论基础来源于1、四时养生学；2、扶正与祛邪；3、气血理论；4、精气学说：5、肾命学说：6、治虚三本论。

慢性疾病或因虚致实，或因实致虚，然而迁延日久，多呈虚实夹杂、本虚标实之势。若遇外感风寒、饮食劳倦、七情触犯，则更虚其本，而形成虚者愈虚、实者愈实的恶性循环。故而此时的疾病多处于以本虚为主导，夹杂邪实的过程。膏方中多入补益之剂，辨气血阴阳有余不足而配制，可扶助正气、燮理阴阳，使正虚得复，“正气内盛，邪不可干”，故可阻遏外邪侵袭，提升自身之抗邪能力。一方面长养了正气，使脏腑虚损的状态得到纠正，则其功能也慢慢的恢复，从而使气血渐充，经脉通盛，则邪实亦可驱除。另一方面，气血阴阳之虚损日久，必伤及肾中精气，动及人生根本。

《金匮真言论》云：“夫精者，身之本也”，《六节藏象论》云：“肾者主蛰，封藏之本，精之处也”，《玉机真藏论》云：“故邪气胜者，精气衰也”，呼吸系统慢性疾病反复发作，本已亏虚，更易招致外邪，而重虚其精，所以肾精亏虚又是这些疾病所共有的表现。故而《金匮真言论》指出：“故藏于精者，春不病温”，可见精气充盛对于疾病的重要性。而《阴阳应象大论》更是昭示大法：“精不足，补之以味”，膏方之中或配味厚滋腻之品，或伍血肉有情之品，善于填精扶羸，培本固元。总之有方对于这些疾病的关键的作用在于通过扶正填精，使正胜邪却，阻断疾病的恶性循环。